Google оголосила про вихід AlphaGenome 2 — моделі нового покоління, яка прогнозує, як послідовності ДНК та їхні варіації впливають на конкретні типи клітин людини, надаючи науковцям потужний новий інструмент для виявлення клітинних причин захворювань.
Модель поєднує біологію окремих клітин і генетику людини, перетворюючи статичні атласи клітин на потужну прогностичну систему. Це надає науковцям інструмент для точного виявлення клітинних причин захворювань і прискорення розробки нових ліків.
На відміну від попередніх інструментів, що базувалися на усереднених показниках цілих тканин, AlphaGenome 2 є умовною (conditional) моделлю. Вона здатна аналізувати тонкі відмінності всередині спеціалізованих клітин (як-от імунні клітини чи клітини серцевого м'яза) без потреби в повторному навчанні. Навчена на понад 100 мільйонах профілів окремих клітин, модель ідентифікує майже вдвічі більше причинних варіантів ДНК і спрямованих ефектів генів, а також дозволяє відновлювати відсутні експериментальні дані (міжмодальне прогнозування).
Модель допомагає розв'язати давню проблему біології — пов'язати дані повногеномних асоціативних досліджень (GWAS) із конкретними клітинами, де розвивається патологія. Завдяки попередньо розрахованим прогнозам для сотень станів людських клітин, AlphaGenome 2 дозволяє точно будувати карти зв'язків між віддаленими регуляторними перемикачами (енхансерами) та їхніми цільовими генами у первинних клітинах людини, визначаючи чи підвищує варіант ДНК активність гена, чи пригнічує її.
AlphaGenome 2 та інтерактивні навчальні матеріали Colab уже доступні для некомерційних досліджень через AlphaGenome API, а також у режимі приватного попереднього перегляду для комерційних розробок. Незабаром інструмент з'явиться у вигляді AlphaGenome 2 Skills на агентній платформі розробки Google Antigravity, що дозволить дослідникам поєднувати спеціалізовані біологічні моделі з мультимодальними можливостями ШІ.
